自2005年起，王福清教授级高工担任西藏生物制造创新型企业总工程师和“青藏高原特色农牧产品深加工国家地方联合工程研究中心”主任、“西藏藏中药饮片加工工程研究中心”主任，带领团队开展了大量依托西藏特色资源的科研开发工作，攻克了高原低温低氧生物加工中的多项技术难题并实现产业化，填补国内多项技术空白，奠定了高原生物技术与产业基础。2011年，所在企业被科技部等三部委认定为国家“第三批创新型企业”。王福清热心学会工作和学术交流活动，2024年被增选为中国发明协会会士，连续兼任中国医药企业管理协会副会长和中国药学会理事或常务理事及中国药学会生化与生物技术药物专业委员会副主任等。

王福清作为负责人的“高原生物制造工程技术创新团队”入选科技部创新人才推进计划重点领域创新团队。个人被国务院批准为享受政府特殊津贴人员，获得2023年度何梁何利基金“科学与技术创新奖”、第二十四届“吴阶平•保罗•杨森医学药学奖”、“第十七届中国药学发展奖创新药物奖”和第十三届发明创业奖人物奖特等奖（并被授予“当代发明家”荣誉称号）等。先后主持国家和西藏项目20余项，发表论文30余篇、专著2部，获得授权国家发明专利23项，获得国家科学技术进步奖二等奖2项、中国药学会科学技术奖一等奖1项、中国发明协会发明创业奖•创新奖一等奖1项等。